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8 January 2013 Identification and Characterization of the Genomic Termini and Cleavage/Packaging Signals of Gallid Herpesvirus Type 2
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Abstract
Herpesvirus replication within host cells results in concatemeric genomic DNA, which is cleaved into unit-length genomes and packaged into the capsid by a complex of proteins. The sites of cleavage have been identified for many herpesviruses, and conserved signaling sequences involved in cleavage and packaging have been characterized. The cleavage/packaging motifs pac-1, pac-2, and DR1 and two distinct groups of telomeric repeat sequences (static TRS and variable TRS) have been identified. By sequencing the termini of the gallid herpesvirus type 2 (GaHV-2) strain CU-2, two different cleavage sites (classical and aberrant) have been identified. Unlike classical cleavage of human herpesvirus type 1, which occurs within the DR1 site, classical cleavage of the GaHV-2 concatemers occurs 8.5 bp upstream of the DR1 site and results in an S-terminus containing telomeric repeats. Aberrant cleavage occurs the same distance from the DR1 site and generates a telomeric S-terminus but an L-terminus lacking an a sequence. These results are consistent with previous findings in other herpesviruses and should prove useful in the future study and manipulation of the GaHV-2 genome.Identificación y caracterización de las terminales genómicas y de las señales de disociación y de empaquetado del herpesvirus de las gallinas serotipo 2.La replicación de los herpesvirus dentro de las células huésped resulta en la producción de ADN genómico concatémero, que se disocia en genomas de longitud unitaria y son empaquetados en la cápside por un complejo de proteínas. Los sitios de disociación se han identificado para varios herpesvirus, y se han caracterizado las secuencias conservadas de señalización implicadas en la disociación y en el empaquetado. Se han identificado los motivos de disociación y empaquetado pac-1, pac-2 y DR1 y dos grupos distintos de secuencias repetidas teloméricas (TRS estáticas y TRS variables). Mediante la secuenciación de los extremos del herpesvirus de las gallinas serotipo 2 (GaHV-2), cepa CU-2, se identificaron dos sitios de corte diferentes (uno clásico y otro aberrante). A diferencia de la disociación clásica de herpesvirus humano tipo 1, que se produce dentro del sitio DR1, la disociación clásica de los concatémeros del herpesvirus de las gallinas tipo 2 se produce a 8.5 pares de bases orientadas al extremo 5' del sitio DR1 y resulta en un S-terminal que contiene repeticiones teloméricas. La disociación aberrante se produce a la misma distancia del sitio DR1 y genera un S-terminal telomérico, pero un L-terminal que carece de una secuencia a. Estos resultados son consistentes con los resultados anteriores en otros herpesvirus y debería ser útil en el estudio futuro y la manipulación del genoma del herpesvirus de las gallinas serotipo 2.
American Association of Avian Pathologists
Jeremy D. Volkening and Stephen J. Spatz "Identification and Characterization of the Genomic Termini and Cleavage/Packaging Signals of Gallid Herpesvirus Type 2," Avian Diseases 57(2s1), (8 January 2013). https://doi.org/10.1637/10410-100312-Reg.1
Received: 15 October 2012; Accepted: 1 November 2012; Published: 8 January 2013
JOURNAL ARTICLE
8 PAGES


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