The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) occurs over a broad latitudinal range from South America to Canada. Thirty-eight subspecies are recognized, 14 of which occur in Mexico. Genetic studies in Latin America are lacking and the diversity and structure of white-tailed deer in Mexico are unknown. We sampled white-tailed deer from 13 sites in the range of 5 subspecies occurring in Mexico, O. v. texanus, O. v. carminis, O. v. veraecrucis, O. v. sinaloae, and O. v. yucatanensis. We estimated genetic diversity and structure based on 12 microsatellite DNA loci. Observed heterozygosity (H_O) was comparable to that of white-tailed deer in the United States (H_O = 0.53–0.64), with the exception of O. v. yucatanensis (H_O = 0.41). We observed statistically significant genetic structure among all 13 sites (F_ST = 0.15). Analysis of molecular variance revealed that grouping sites by subspecies (F_SC = 0.09) or geographic region (F_SC = 0.13–0.14) explained a moderate portion of genetic variation. However, no higher-level group minimized differentiation among populations within the subspecies or regional groups (F_ST = 0.16–0.20). Pairwise genetic distances among sites were correlated with geographic distance (r² = 0.38), but some geographically proximate sites were genetically differentiated (F_ST > 0.20), especially in the Yucatan. Deer in the Yucatan were genetically differentiated from other subspecies and had comparatively lower genetic diversity, consistent with the biogeographic history of the region. Populations of white-tailed deer in Mexico are subject to a range of management challenges. Additional research is needed to understand the effect of management on the diversity and genetic structure of white-tailed deer.

El venado de cola blanca (Odocoileus virginianus) se distribuye en un amplio rango latitudinal desde el sur de América hasta Canadá. De las 38 subespecies reconocidas, 14 habitan en México. Debido al número limitado de estudios genéticos en Latinoamérica, la diversidad y estructura poblacional del venado de cola blanca en México es desconocida. En este estudio, muestreamos venado de cola blanca de 13 sitios ubicados dentro del rango de distribución de 5 subespecies de México, O. v. texanus, O. v. carminis, O. v. veraecrucis, O. v. sinaloae, and O. v. yucatanensis. La diversidad y estructura genética fue estimada con 12 marcadores microsatélites. La heterocigosidad observada fue comparable a lo observado en el venado de cola blanca de Norteamérica (H_O = 0.53–0.64), con excepción de O. v. yucatanensis (H_O = 0.41). Se observó una estructura genética significativa entre los 13 sitios de muestreo (F_ST = 0.15). El análisis de varianza molecular reveló que los sitios de muestreo agrupados por subespecie (F_SC = 0.09) o región geográfica (F_SC = 0.13–0.14) explicaron una porción moderada de la variación genética. Sin embargo, la diferenciación entre las poblaciones no fue minimizada a un nivel de agrupamiento mayor, es decir dentro de subespecies o grupos regionales (F_ST = 0.16–0.20). La distancia genética entre sitios de muestreo estuvo correlacionada con la distancia geográfica (r² = 0.38), pero algunos sitios geográficamente próximos estuvieron genéticamente diferenciados (F_ST > 0.20), especialmente en Yucatán. El venado de cola blanca de Yucatán fue diferenciado genéticamente de las otras subespecies y fue comparativamente el de menor diversidad genética, lo cual es consistente con la historia biogeográfica de la región. Las poblaciones de ve