Annotate-On software ( https://www.recolnat.org/en/annotate) is freely available to botanists for research on virtual herbarium collections. It contains tools to easily and quickly perform morphological and morphometric analyses on images of specimens including physical measurements (lengths, perimeters, areas, angles, counts) and descriptive annotations. The images derive from various sources such as the online Récolnat infrastructure database ( https://explore.recolnat.org/), online image URLs or other images. Image libraries can be sorted using the keyword management tool within the software. Annotate-On is built on models structured as lists of editable descriptive characters (observations or measurements) dedicated to a study, a species, an hypothesis, etc. Observations and measurements based on these models can be exported to spreadsheets, data processing software, R applications or deep learning modules. Annotate-On is associated with Xper3 biodiversity data management software ( https://www.xper3.fr/).

Récolnat Annotate-On : un outil pour améliorer votre expérience avec les collections virtuelles.

Le logiciel Annotate-On ( https://www.recolnat.org/en/annotate) est mis librement à la disposition des botanistes pour mener des recherches sur des collections d'herbiers virtuels. Il contient des outils pour réaliser facilement et rapidement des analyses morphologiques et morphométriques sur des images de spécimens: mesures physiques (longueurs, périmètres, surfaces, angles), marquage et comptage de points d'intérêts, et annotations descriptives. Les images proviennent de sources variées: outre la base de données de l'infrastructure Récolnat ( https://explore.recolnat.org/) en ligne, toute URL d'images en ligne, ou encore les images d'un disque dur, d'un appareil photographique, d'un microscope, etc. Ces bibliothèques d'images peuvent être classées à l'aide de l'outil de gestion de mots-clés du logiciel. Les annotations effectuées avec Annotate-On sont structurées par une liste de caractères descriptifs éditables – observations ou mesures – dédiés à une étude, une espèce, une hypothèse, etc. Ce modèle peut être importé depuis le logiciel Xper 3, logiciel de gestion de données sur la biodiversité ( https://www.xper3.fr/), ou exporté vers lui. Les observations et mesures fondées sur ces modèles sont exportables vers des tableurs, des logiciels de traitement de données, l'application R ou encore des modules d'apprentissage profond (deep learning).