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4 January 2013 Species Determination of Fowl Adenoviruses Based on the 52K Gene Region
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Abstract

In the present study, the classification of fowl adenoviruses (FAdVs) based on a part of the 52K gene region was described. A total of 44 FAdV field samples from different countries and sources were detected using a recently developed SYBR Green–based real-time PCR. Amplified products were sequenced, and phylogenetic analyses were conducted on the basis of the 116-bp region. For comparison, the already published sequences of the 52K gene region of aviadenoviruses were used in the analyses. The phylogenetic analysis allowed the grouping of the FAdVs into the established five different FAdV species: Fowl adenovirus A to Fowl adenovirus E. The existence of the species was supported by high bootstrap values (>70%). This method provides the advantages of quantitation and high sensitivity for FAdV detection in combination with species assignment.

Nota de Investigación—Determinación de la especie de adenovirus aviares con base en la región del gene 52K.

En el presente estudio, se describe una clasificación de adenovirus aviar (FAdVs) basada en una parte de la región del gene 52K. Un total de 44 muestras de campo de adenovirus aviares de diferentes países y fuentes fueron detectadas utilizando un método de PCR en tiempo real con SYBR Green recientemente desarrollado. Los productos amplificados fueron secuenciados, y los análisis filogenéticos se llevaron a cabo con base en una región de 116 pares de bases. Con fines de comparación, las secuencias ya publicadas de la región del gen 52K de aviadenoviruses fueron utilizados en los análisis. El análisis filogenético permitió la agrupación de los adenovirus aviares en las cinco diferentes especies establecidas Adenovirus aviar A hasta el Adenovirus aviar E. La existencia de las especies fue apoyada por altos valores de remuestreo por bootstraping (>70%). Este método proporciona las ventajas de la cuantificación y una alta sensibilidad para la detección de adenovirus aviares en combinación con la tipificación de las especies.

American Association of Avian Pathologists
Ayse Günes, Ana Marek, and Michael Hess "Species Determination of Fowl Adenoviruses Based on the 52K Gene Region," Avian Diseases 57(2), 290-294, (4 January 2013). https://doi.org/10.1637/10323-081012-ResNote.1
Received: 14 August 2012; Accepted: 1 December 2012; Published: 4 January 2013
JOURNAL ARTICLE
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