Bahareh Nowruzi, Adriana Sturion Lorenzi
Cryptogamie, Algologie 45 (4), 39-51, (18 April 2024) https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2024v45a4
KEYWORDS: cyanobacteria, Nostocales, freshwater, temperate climate, polyphasic approach, cyanobacteria, Nostocales, eau douce, climat tempéré, approche polyphasique
To increase the knowledge on diversity of freshwater cyanobacteria, we have characterized a novel filamentous, benthic cyanobacterium isolated from a pond in Golestan province, Iran. The isolate was studied using a polyphasic approach based on morphological and molecular characteristics, including phylogenetic and structural analysis of the 16S rRNA gene sequence and 16S to 23S internal transcribed spacer (ITS), respectively. The overall morphology of the isolate was similar to Nostocalean member's strains with non-tapering filaments and distributed heterocytes. However, the molecular analyses suggested that it was more closely related to the lithobiont and rock-dwelling Goleter apudmare Miscoe & J.R.Johansen, which has tapered filaments and basal heterocytes. The 16S rRNA gene phylogenetic analysis, based on bayesian inference and maximum likelihood methods, placed the isolate close to G. apudmare. The D1-D1', Box-B and V3 helixes of the isolate's ITS sequence were different when compared to other Goleter ITS sequences. Similar to G. apudmare HA4356-MV2 ( JN385288.1) and Goleter sp. CHAB TP201702 ( MT488126.1), tRNA genes were absent from the amplified ITS sequence in the studied isolate. These morphological and molecular characteristics differentiate this isolate from all other Goleter taxa described so far, which contributes to extend the knowledge on cyanobacterial diversity and occurrence of benthic cyanobacteria in Iranian freshwaters.
Caractérisation morphologique et moléculaire de Goleter sp. (Nostocales, Nostocaceae) isolée de l'eau douce en Iran.
Pour accroître les connaissances sur la diversité des cyanobactéries d'eau douce, nous avons caractérisé une nouvelle cyanobactérie benthique filamenteuse isolée d'un étang de la province du Golestan, en Iran. L'isolat a été étudié en utilisant une approche polyphasique basée sur les caractéristiques morphologiques et moléculaires, comprenant l'analyse phylogénétique et structurelle de la séquence du gène de l'ARNr 16S et de l'espaceur transcrit interne (ITS) 16S à 23S, respectivement. La morphologie globale de l'isolat était similaire à celle des souches membres des Nostocales avec des filaments non effilés et des hétérocytes distribués. Cependant, les analyses moléculaires suggèrent qu'il était plus étroitement lié au lithobionte et au Goleter apudmare Miscoe & J.R.Johansen vivant dans les roches, qui possède des filaments effilés et des hétérocytes basaux. L'analyse phylogénétique du gène de l'ARNr 16S, basée sur les méthodes d'inférence bayésienne et de vraisemblance maximale, a placé l'isolat à proximité de G. apudmare. Les hélices D1-D1', Box-B et V3 de la séquence ITS de l'isolat étaient différentes par rapport aux autres séquences Goleter ITS. De la même manière que G. apudmare HA4356-MV2 ( JN385288.1) et Goleter sp. CHAB TP201702 ( MT488126.1), les gènes d'ARNt étaient absents de la séquence ITS amplifiée dans l'isolat étudié. Ces caractéristiques morphologiques et moléculaires différencient cet isolat de tous les autres taxons de Goleter décrits jusqu'à présent, ce qui contribue à étendre les connaissances sur la diversité cyanobactérienne et la présence de cyanobactéries benthiques dans les eaux douces iraniennes.