Guilherme Scotta Hentschke, Kléber Renan de Souza Santos, Leandro de Mattos, Flávio Oliveira, Vitor M. Vasconcelos
Cryptogamie, Algologie 45 (6), 63-75, (12 July 2024) https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2024v45a6
KEYWORDS: South America, Brazil, tropical environments, Subtropical environments, cyanobacteria, phylogeny, méri ue du Sud, Brésil, environnements tropicaux, environnements subtropicaux, cyanobactéries, phylogénie
In this paper we present a bibliographical review of the newly described Brazilian cyanobacterial genera, based on 16S rDNA analysis. Moreover, we discuss their position according to the current classification system of Cyanobacteria. Additionally, in order to comprehend the diversity of Brazilian 16S rDNA sequences deposited in GenBank (NCBI), we constructed a phylogeny based on an alignment of these sequences with cyanobacterial reference strains. The bibliographical review resulted in 26 papers. We identified 30 cyanobacterial genera described from Brazil, distributed across eight orders. The order Nostocales is the most well-represented with 11 genera. The genera described based on Brazilian strains are from terrestrial, aquatic (marine and freshwater), and extreme habitats (alkaline saline lakes). The terrestrial habitat hosts the largest number of genera, with 17 in total. The studies are primarily concentrated in the Atlantic Rainforest, Amazon, Caatinga, and Pantanal Biomes, while the Pampa Biome remains unstudied. Most of the Brazilian genera are monophyletic, with the exception of Brasilonema Fiore, Sant'Anna, de Paiva Azevedo, Komarek, Kaštovský, Sulek & Lorenzi, which is intermixed with Iphinoe Lamprinou & Pantazidou and Symphyonemopsis Tiwari & Mitra; and Capilliphycus Caires, Sant'Anna & Nunes, which is polyphyletic. Genera like Marmoreocelis Machado-de-Lima & Branco, Monilinema Malone, Genuário, Vaz, Fiore & Sant'Anna, Insularia Araújo, Schnadelbach, Nunes & Caires, and Microlinema Araújo, Schnadelbach, Nunes & Caires require revision in their taxonomical classifications. Our findings reveal that numerous Brazilian 16S rDNA sequences in GenBank are unidentified or misidentified, indicating a need for at least 15 genera to be described based on these strains. Here we also elucidate that the Brazilian cyanobacterial diversity is significantly underestimated.
Un voyage à travers les cyanobactéries au Brésil: une revue des genres nouveaux et des séquences de l'ARNr 16S.
Dans cet article, nous présentons une revue bibliographique des genres de cyanobactéries brésiliens nouvellement décrits, basée sur l'analyse de l'ADN ribosomique 16S et, nous discutons de leur position selon le système de classification actuel des cyanobactéries. Afin de comprendre la diversité des séquences 16S rDNA brésiliennes déposées dans GenBank (NCBI), nous avons construit une phylogénie basée sur un alignement de ces séquences avec des souches de référence de cyanobactéries. La revue bibliographique a été réalisée sur la base de 26 articles. Nous avons identifié 30 genres de cyanobactéries décrits au Brésil, répartis dans huit ordres. L'ordre des Nostocales est le plus représenté avec 11 genres. Les genres décrits à partir de souches brésiliennes proviennent de milieux terrestres, aquatiques (marins et d'eau douce), ainsi que d'habitats extrêmes (lacs salins alcalins). L'habitat terrestre héberge le plus grand nombre de genres, avec un total de 17. Les études sont principalement concentrées dans les biomes de la forêt atlantique, de l'Amazonie, de la Caatinga et du Pantanal, tandis que le biome des Pampas reste non étudié. La plupart des genres brésiliens sont monophylétiques, à l'exception de Brasilonema Fiore, Sant'Anna, de Paiva Azevedo, Komarek, Kaštovský, Sulek & Lorenzi, qui est entremêlé avec Iphinoe Lamprinou & Pantazidou et Symphyonemopsis Tiwari & Mitra; et de Capilliphycus Caires, Sant'Anna & Nunes, qui est polyphylétique. Des genres comme Marmoreocelis Machado-de-Lima & Branco, Monilinema Malone, Genuário, Vaz, Fiore & Sant'Anna, Insularia Araújo, Schnadelbach, Nunes & Caires, et Microlinema Araújo, Schnadelbach, Nunes & Caires nécessitent une révision de leurs classifications taxonomiques. Nos résultats révèlent que de nombreuses séquences brésiliennes de 16S rDNA dans GenBank ne sont pas identifiées ou mal identifiées, ce qui indique la nécessité de décrire au moins 15 genres basés sur ces souches. Cet article met également en évidence que la diversité des cyanobactéries brésiliennes est nettement sous-estimée.