Although molecular phylogenetic studies strongly support the monophyly of the Pygopodoidea, which comprise the gekkotan families Diplodactylidae, Carphodactylidae, and Pygopodidae, relationships among these constituent families are less robust. Morphological evidence for a particular three-taxon statement of pygopodoid relationships is hindered by the highly derived postcranial and trophic anatomy of limbless pygopodids relative to limbed gekkotans. We discuss variation in the temporal region of the gekkotan skull and identify a posteriorly dilated squamosal bone with a medially directed process, a character that is shared uniquely within Gekkota and more broadly within extant Squamata, by carphodactylids and pygopodids. The pygopodoid relationships (Diplodactylidae [Carphodactylidae, Pygopodidae]) implied by squamosal morphology are consistent with those receiving the greatest support from the most complete nuclear gene phylogenies.

Si bien, las filogenias moleculares apoyan fuertemente la monofilia de Pygopodoidea (i.e. los gekkotas de las familias Diplodactylidae, Carphodactylidae and Pygopodidae), las relaciones entre las familias que constituyen este clado están débilmente soportadas. La evidencia morfológica para el patrón de ramificación de las tres familias de pygopodoideos esta enmascarada por las extremas modificaciones anatómicas y tróficas de los pygopódidos ápodos con respecto a los Geckos. En este trabajo discutimos las variaciones de la región temporal del cráneo de los Gekkota, e identificamos un hueso escamoso expandido en forma de maza con un proceso medial, el cual es un carácter que solo está presente en carphodactylidos y pygopódidos dentro de los Gekkota, y los escamados vivientes. La morfología del hueso escamoso implica que las relaciones filogenéticas de los pygopodoideos es (Diplodactylidae (Carphodactylidae, Pygopodidae)). Lo anterior es consistente con otras hipótesis derivadas de análisis filogenéticos usando varios genes nucleares.