Se identificaron mediante estudio de los genitales de machos a tres especies de barrenadores de la caña de azúcar distribuidos en 28 sitios de muestreo de las zonas cañeras norte y centro de Sinaloa. La identificación molecular de éstas se hizo secuenciando el gen de la subunidad I de la enzima citocromo c oxidasa (COI) del ADN mitocondrial. Se identificó a Diatraea considerata Heinrich, D. grandiosella Dyar, y Eoreuma loftini (Dyar) distribuidas en la zona cañera norte (Los Mochis) y centro (El Dorado). Las secuencias de nucleótidos de estas especies comparadas en el GenBank tuvieron similitud con D. considerata 99% (673 pb) (acc. no. KP259614), para D. grandiosella del 97% (647 pb) (acc. no. KP259615), y para E. loftini del 99% (645 pb) (acc. no. KP259616). Se hizo también un análisis de Máxima Verosimilitud (ML) para determinar la proximidad entre estas especies, encontrando que las secuencias corresponden a estas mismas especies reportadas en el GenBank, con el 96% para D. considerata, 88% para E. loftini, y el 100% para D. grandiosella, dando con esto mayor precisión sobre la identidad de las especies distribuidas en esa área. Esta información es básica para la implementación de futuras estrategias de control biológico de estas plagas en Sinaloa.