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1 September 2016 Detección de Gen CYP4 en el Genoma de Cryptolaemus montrouzieri en Base a Secuencias Ortólogas y Uso de Codones
Merced José Eduardo Jiménez-Diosdado, Maribel Mireles-Martínez, Jesús M. Villegas-Mendoza, Raymundo Rosas-Quijano, Ninfa M. Rosas-García
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Abstract

En este estudio se detectó el gen CYP4 de Cryptolaemus montrouzieri Mulsant (Coleoptera: Coccinellidae) mediante el diseño de oligonucleótidos obtenidos a partir de la selección de siete secuencias proteicas parciales de Anopheles gambiae Giles (Diptera: Culicidae) asociadas al gen CYP4 y analizados mediante una tabla de uso de codones elaborada en función de ocho genes de Harmonia axyridis Pallas (Coleoptera: Coccinellidae) que es un insecto emparentado a C. montrouzieri. Las secuencias aminoacídicas ortólogas fueron alineadas para determinar las zonas de homología y se elaboró una tabla de uso de codones para H. axyridis. Las secuencias nucleotídicas obtenidas se analizaron con el programa GCUA para determinar los codones más utilizados, reducir la degeneración y tener mejor amplificación. Los productos amplificados se clonaron y se secuenciaron. El número efectivo de codones para H. axyridis fue de 2996. Se observa un mayor uso relativo de codones predominantes con AT. Los oligonucleótidos diseñados 5´GAAGUUGAUACHUUUAUGUUUG3´ y 3´AAARTTTTCWGGRTTTGGAWA 5′, amplificaron un fragmento de 569 pb con alineamiento significativo a una secuencia parcial del citocromo P450 en Aedes aegypti Linnaeus (Diptera: Culicidae) y Tribolium castaneum Herbst (Coleoptera: Tenebrionidae). El uso de secuencias ortólogas y su análisis mediante el uso de codones es útil para la identificación molecular de genes de interés.

Merced José Eduardo Jiménez-Diosdado, Maribel Mireles-Martínez, Jesús M. Villegas-Mendoza, Raymundo Rosas-Quijano, and Ninfa M. Rosas-García "Detección de Gen CYP4 en el Genoma de Cryptolaemus montrouzieri en Base a Secuencias Ortólogas y Uso de Codones," Southwestern Entomologist 41(3), 771-782, (1 September 2016). https://doi.org/10.3958/059.041.0319
Published: 1 September 2016
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