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1 September 2012 Genetic and Conservation Status of a Relictual Population of the Hispid Cotton Rat (Sigmodon hispidus eremicus)
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Abstract

DNA sequences from the mitochondrial cytochrome-b gene were examined in individuals of the hispid cotton rat (Sigmodon hispidus eremicus) collected from an isolated population in southwestern Arizona. Analyses indicated unique DNA substitutions and haplotypes that were restricted to the population in Arizona and an overall genetic affiliation to populations of the western lineage of S. hispidus, particularly to the population from Otero County, New Mexico. Estimates of time since divergence indicated an allopatric relationship with other populations of S. hispidus ≥150,000 years ago. Additionally, data obtained from analyses of amplified fragment-length polymorphisms indicated that S. h. eremicus exhibits lower genetic diversity compared to other populations. Together, these data along with detection of two replacements of apomorphic nonsynonymous amino acids and genetic divergence among amplified length polymorphisms argue that S. h. eremicus is unique from other populations of S. hispidus and that conservation considerations are encouraged.

Secuencias de ADN del gen mitocondrial de citocromo-b fueron examinadas en individuos de la rata algodonera crespa (Sigmodon hispidus eremicus) colectadas de una población aislada del suroeste de Arizona. Los análisis indicaron substituciones únicas de ADN y haplotipos que estuvieron restringidos a la población en Arizona, y una afiliación genética en general a poblaciones del linaje oeste de S. hispidus, particularmente a una población del condado de Otero, en Nuevo México. Estimaciones del tiempo de divergencia indicaron una relación alopátrica con otras poblaciones de S. hispidus hace ≥150,000 años. Adicionalmente, datos obtenidos de los análisis del polimorfismo de fragmentos amplificados de longitud indicaron que S. h. eremicus exhibe una diversidad genética menor que la de otras poblaciones. Conjuntamente, esos datos y la detección de dos reemplazos apomórficos en aminoácidos no sinónimos, más la divergencia genética entre los polimorfismos de fragmentos amplificados de longitud, debaten que S. h. eremicus es única al compararla con otras poblaciones de S. hispidus, y se incentiva a que se considere esta población para su conservación.

Robert D. Bradley, Justin B. Lack, Russell S. Pfau, Lottie L. Peppers, Dallas D. Henson, Andrew O. Stallings, Christine N. Hoang, and Ronald A. Van Den Bussche "Genetic and Conservation Status of a Relictual Population of the Hispid Cotton Rat (Sigmodon hispidus eremicus)," The Southwestern Naturalist 57(3), 231-239, (1 September 2012). https://doi.org/10.1894/0038-4909-57.3.231
Received: 1 October 2010; Accepted: 1 May 2012; Published: 1 September 2012
JOURNAL ARTICLE
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