Despite the importance of the poultry gut, remarkably little is known about the complex gut microbial community. Enteric disease syndromes such as runting-stunting syndrome in broiler chickens and poult enteritis complex in young turkeys are difficult to characterize and reproduce in the laboratory. A great deal of work has been done to characterize the bacterial population in the poultry gut, leading to useful performance-based interventions such as direct-fed microbial preparations. Advances in the application of rapid molecular diagnostics and the advent of the next generation of nucleic acid sequencing have allowed researchers to begin to decipher the microbial community in complex environmental samples. Researchers have made great strides recently in placing names to some of the unknown and undescribed small viruses in the poultry gut such as parvoviruses, picornaviruses, picobirnavirus, and calicivirus. Investigation into the novel avian astroviruses continues, and recent progress has been made in the molecular characterization of the avian rotaviruses. This review will focus on the recent advances that have been made in the discovery, description, and characterization of the multitude of viruses that reside in the poultry gut.

Estudio Recapitulativo—Avances recientes en la caracterización de los virus entéricos aviares.

A pesar de la importancia del tracto intestinal en las aves, se conoce muy poco acerca de la compleja comunidad microbiana intestinal. Los síndromes de enfermedades entéricas, tales como el síndrome de mala absorción y el complejo de enteritis de los pavipollos, son difíciles de caracterizar y reproducir en el laboratorio. Una gran parte de los esfuerzos se han enfocado para caracterizar la población bacteriana en el intestino de las aves comerciales, lo que ha conducido a la aplicación de prácticas útiles basadas en el desempeño, tales como la alimentación directa de preparaciones microbianas. Los avances en la aplicación de métodos diagnósticos moleculares rápidos y el advenimiento de la secuenciación de ácidos nucleicos de nueva generación han permitido a los investigadores el comenzar a descifrar la comunidad microbiana en muestras ambientales complejas. Los investigadores han hecho grandes avances recientemente en asignar los nombres de algunos de los virus pequeños desconocidos y que no habían sido descritos en el intestino de las aves comerciales, tales como parvovirus, picornavirus, picobirnavirus, y calicivirus. Las investigaciones sobre los nuevos astrovirus aviares continúa, y se han logrado avances recientes en la caracterización molecular de los rotavirus aviares. Esta revisión se centrará en los últimos avances sobre el descubrimiento, la descripción y caracterización de la multitud de virus que se encuentran en el intestino de las aves comerciales.